Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm4340L7N2C4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms