Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm2888K7N746 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm2888K7N746 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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