Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm379J3QQ19 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm379J3QQ19 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm379J3QQ19 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm379J3QQ19 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm379J3QQ19 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm379J3QQ19 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms