Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm3336J3QMQ6 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3336J3QMQ6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms