Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Susd1E9Q3H4 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms