Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1P8

Irf2bp2, Interferon regulatory factor 2-binding protein 2, mousemouse

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Length 570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf2bp2E9Q1P8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Irf2bp2E9Q1P8 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Irf2bp2E9Q1P8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Irf2bp2E9Q1P8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Irf2bp2E9Q1P8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Irf2bp2E9Q1P8 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Irf2bp2E9Q1P8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
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