Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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