Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms