Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3173A6NAS3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3173A6NAS3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3173A6NAS3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm3173A6NAS3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm3173A6NAS3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3173A6NAS3 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms