Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cavin4A2AMM0 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cavin4A2AMM0 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cavin4A2AMM0 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cavin4A2AMM0 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cavin4A2AMM0 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cavin4A2AMM0 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cavin4A2AMM0 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cavin4A2AMM0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cavin4A2AMM0 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cavin4A2AMM0 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 743.7 ms