Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Pramef6A2A8M8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Pramef6A2A8M8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pramef6A2A8M8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms