Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChmQ9QXG2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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