Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER97

Ngb, Neuroglobin, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgbQ9ER97 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NgbQ9ER97 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NgbQ9ER97 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NgbQ9ER97 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NgbQ9ER97 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NgbQ9ER97 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NgbQ9ER97 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NgbQ9ER97 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
NgbQ9ER97 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NgbQ9ER97 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NgbQ9ER97 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms