Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn34b2Q9D9N2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms