Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zbed3Q9D0L1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Zbed3Q9D0L1 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Zbed3Q9D0L1 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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