Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms