Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms