Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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Pfdn1Q9CWM4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pfdn1Q9CWM4 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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