Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdca4Q9CWM2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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