Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp3Q9CQ10 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms