Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6cQ99N08 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms