Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
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