Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sh3bgrl3Q91VW3 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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