Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms