Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Tnik-201ENSMUST00000159236 12276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Celf1-203ENSMUST00000068747 7614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms