Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp27Q8CEG8 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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