Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Atg4dQ8BGV9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4dQ8BGV9 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Atg4dQ8BGV9 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Atg4dQ8BGV9 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Atg4dQ8BGV9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Atg4dQ8BGV9 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4dQ8BGV9 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms