Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms