Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm12696-201ENSMUST00000122361 905 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm15133-201ENSMUST00000139019 843 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm29436-202ENSMUST00000189054 1172 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ClmQ7TSN2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms