Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms