Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Atg9bQ6EBV9 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Atg9bQ6EBV9 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Atg9bQ6EBV9 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Atg9bQ6EBV9 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Atg9bQ6EBV9 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Atg9bQ6EBV9 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Atg9bQ6EBV9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Atg9bQ6EBV9 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Atg9bQ6EBV9 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Atg9bQ6EBV9 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Atg9bQ6EBV9 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Atg9bQ6EBV9 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Atg9bQ6EBV9 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg9bQ6EBV9 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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