Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gbf1Q6DFZ1 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gbf1Q6DFZ1 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gbf1Q6DFZ1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gbf1Q6DFZ1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gbf1Q6DFZ1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gbf1Q6DFZ1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gbf1Q6DFZ1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gbf1Q6DFZ1 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gbf1Q6DFZ1 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gbf1Q6DFZ1 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gbf1Q6DFZ1 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gbf1Q6DFZ1 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms