Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gja3Q64448 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja3Q64448 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja3Q64448 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja3Q64448 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja3Q64448 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja3Q64448 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja3Q64448 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja3Q64448 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja3Q64448 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja3Q64448 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja3Q64448 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja3Q64448 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja3Q64448 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja3Q64448 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja3Q64448 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja3Q64448 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja3Q64448 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja3Q64448 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja3Q64448 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja3Q64448 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja3Q64448 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja3Q64448 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja3Q64448 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja3Q64448 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja3Q64448 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja3Q64448 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja3Q64448 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja3Q64448 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja3Q64448 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja3Q64448 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gja3Q64448 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja3Q64448 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja3Q64448 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja3Q64448 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja3Q64448 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja3Q64448 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja3Q64448 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja3Q64448 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja3Q64448 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja3Q64448 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja3Q64448 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja3Q64448 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja3Q64448 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gja3Q64448 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gja3Q64448 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gja3Q64448 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gja3Q64448 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gja3Q64448 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gja3Q64448 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja3Q64448 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja3Q64448 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja3Q64448 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gja3Q64448 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gja3Q64448 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gja3Q64448 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja3Q64448 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja3Q64448 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja3Q64448 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja3Q64448 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms