Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cnot7Q60809 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cnot7Q60809 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cnot7Q60809 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cnot7Q60809 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cnot7Q60809 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cnot7Q60809 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cnot7Q60809 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cnot7Q60809 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cnot7Q60809 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnot7Q60809 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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