Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Gm44070-201ENSMUST00000203389 2220 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Gm38148-201ENSMUST00000195166 3012 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Mtmr6-203ENSMUST00000224366 1968 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 D630033O11Rik-205ENSMUST00000210802 2761 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Adamts4-202ENSMUST00000111315 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Hspd1-ps3-201ENSMUST00000119713 1722 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Hgd-203ENSMUST00000160847 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Nup107-202ENSMUST00000167943 3098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Svil-203ENSMUST00000126977 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Atxn1-203ENSMUST00000180110 3901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Eml1-202ENSMUST00000109857 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Gm15834-202ENSMUST00000139825 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Cyp2c50-202ENSMUST00000080171 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Supt5-201ENSMUST00000003527 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Gm9164-201ENSMUST00000118700 1014 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Aldh3b3-202ENSMUST00000179433 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Gm38365-201ENSMUST00000195720 2993 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 5430437J10Rik-202ENSMUST00000227355 634 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Usp28-203ENSMUST00000213874 4109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Gm28758-201ENSMUST00000186123 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Gm28547-201ENSMUST00000186357 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Gm29446-201ENSMUST00000190887 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Ido2-201ENSMUST00000121992 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Olfr943-202ENSMUST00000213176 8275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Pcdhb5-201ENSMUST00000078271 3535 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Rnf121-201ENSMUST00000089052 2344 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Sox2ot-211ENSMUST00000197977 2970 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Gm44998-201ENSMUST00000207091 1768 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Csf3r-201ENSMUST00000030673 3160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Antxrl-201ENSMUST00000058725 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Hk1-201ENSMUST00000072357 3639 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Tulp2-203ENSMUST00000107758 1597 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Pot1a-209ENSMUST00000166445 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Smok2b-202ENSMUST00000162940 2306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Stat6-201ENSMUST00000092074 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 AC120347.1-201ENSMUST00000223326 1639 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Gm4640-201ENSMUST00000203927 2352 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 C330007P06Rik-201ENSMUST00000047486 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Hdac7-206ENSMUST00000119670 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
SvipQ3UZP4 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms