Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm29609Q3UU56 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm29609Q3UU56 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm29609Q3UU56 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm29609Q3UU56 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gm29609Q3UU56 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gm29609Q3UU56 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gm29609Q3UU56 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gm29609Q3UU56 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm29609Q3UU56 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Gm29609Q3UU56 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Gm29609Q3UU56 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Gm29609Q3UU56 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm29609Q3UU56 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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