Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Sec31aQ3UPL0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sec31aQ3UPL0 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sec31aQ3UPL0 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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