Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sox13Q04891 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.4 ms