Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col1a2Q01149 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms