Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Grin2cQ01098 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Grin2cQ01098 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Grin2cQ01098 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Grin2cQ01098 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grin2cQ01098 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Grin2cQ01098 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Grin2cQ01098 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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