Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Grin2bQ01097 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Grin2bQ01097 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms