Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Csrnp1P59054 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms