Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P58686 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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P58686 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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P58686 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P58686 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P58686 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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