Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NcanP55066 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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NcanP55066 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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NcanP55066 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NcanP55066 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NcanP55066 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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