Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TspoP50637 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TspoP50637 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TspoP50637 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms