Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Hoxc13P50207 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Hoxc13P50207 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Hoxc13P50207 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxc13P50207 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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