Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept1P42209 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept1P42209 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept1P42209 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Sept1P42209 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Sept1P42209 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept1P42209 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Sept1P42209 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept1P42209 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept1P42209 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept1P42209 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept1P42209 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept1P42209 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept1P42209 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept1P42209 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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