Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tjp1P39447 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tjp1P39447 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tjp1P39447 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tjp1P39447 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tjp1P39447 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tjp1P39447 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tjp1P39447 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tjp1P39447 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tjp1P39447 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tjp1P39447 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tjp1P39447 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tjp1P39447 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tjp1P39447 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tjp1P39447 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tjp1P39447 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tjp1P39447 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tjp1P39447 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tjp1P39447 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms