Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxrgP28705 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxrgP28705 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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RxrgP28705 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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RxrgP28705 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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RxrgP28705 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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RxrgP28705 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RxrgP28705 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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