Protein–RNA interactions for Protein: P25318

Col8a2, Collagen alpha-2(VIII) chain, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a2P25318 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col8a2P25318 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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